虽然由于低pH、乙醇浓度和低氧含量,啤酒对细菌生长有一定的抑制作用,但某些啤酒腐败细菌（包括乳杆菌、片球菌、梳状菌和巨型球菌）可能导致异味、混浊和发酸。这些质量缺陷使得产品不可接受，经常导致大量经济损失和负面品牌形象。在整个生产过程中,必须防止有害微生物污染,才能实现所需的最终啤酒质量。这种污染可能来自于配料成分（包括酵母）、与产品接触的空气和水体以及环境。

矿泉水是一种有价值的自然资源，在以高纯水和外观鲜亮的瓶装产品形式出现在商店货架上以前，需要先进行良好净化处理。过滤是实现始终如一的卓越产品质量所必需的关键工艺步骤。根据水源质量的不同，过滤相关成本可能是关键所在。一次性过滤器是一种技术可靠的解决方案，但在高品质水源难以获取或变化的情况下，使用这种过滤器在经济上不可持续。

浸入盐水进行盐渍的加工方法广泛用于世界各地的多种奶酪。在反复浸泡期间，奶酪中的脂肪、凝乳颗粒和微生物，加上蛋白质和其他组分的积累，为耐盐性微生物建立起了营养丰富的环境。另外，重复使用的盐水会成为有害微生物的储存池，例如产生气体或颜料的细菌、酵母菌和霉菌或耐盐病原体，这些微生物会交叉污染奶酪和影响产品质量。为了确保日常生产的稳定性，盐水和盐水浸渍操作的良好控制非常关键。除此之外，盐水处理正在受到越来越多的关注。特定领域的高处理成本或体积限制正在推动进一步回收利用盐水的需求，以节省运行成本，尽可能减少工厂的环境足迹。

烈性酒过滤可能是一项难度极高的工作。不但需要清除可能引起浊度的污染物,同时还要保持产品中提高质量的组分。过滤板是实现这一微妙平衡的传统方法。过滤片采用了同时具备优良吸附能力和深度过滤能力的独特材料基质,使其成为降低烈性酒浊度和消除浑浊现象的理想解决方案。过滤片有多个等级,覆盖广泛的应用范围,从浸果酒过滤到去除褐色烈性酒的冷藏浑浊物,再到白色烈性酒活性炭处理。另外,许多板式和板框式过滤器还可灵活地添加或移除过滤片,以适应批量大小、流量或要过滤的特定产品。

氨基酸、有机酸和维生素等散装食品和饲料配料成分的生产商均采用发酵作为其生产的基础。当今的现代工业生物技术工艺使用精心选择和纯化的微生物细胞培养液来生产更多的各种配料成分并提高生产率。在发酵过程中，微生物在工业生物反应器中繁殖，利用碳水化合物获取能量。微生物在充分控制的通气条件、搅拌速度、温度、pH值等参数条件下生长。。发酵过程可以持续几小时到几天。由微生物产生的代谢终产物是目前使用的许多配料成分的基础。

在先进的苹果酒生产过程中,为了能提供外观亮泽且耐储存的产品,过滤操作是关键。根据传统工艺,苹果酒澄清过程基于硅藻土或过滤片的过滤技术。但是,基于更好的经济性、更简便的操作以及更低的废料量,颇尔的Oenoflow™ XL类型的交叉流过滤系统在过去十年中已经被广泛采用。

茶饮料、果汁和饮料、碳酸软饮料和其它饮料都会因出现耐热嗜酸菌孢子（TAB）而导致腐败。嗜热孢子可能来自于接触果汁生产过程中的农业原材料或天然提取物中的甜味剂、果汁和茶浓缩液或加味料、香精和色素等饮料成分的污染。